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发表表观基因组研究
点击次数:225 发布时间:2015/12/2 9:20:36
DNA甲基化对于理解复杂性状很有帮助,而二型糖尿病(T2D)就是一种相当复杂的性状。这种疾病有许多致病因素,遗传易感性和环境条件都能显著影响个体的发病风险。
通过高通量的全基因组甲基化DNA免疫共沉淀测序MeDIP-seq,获得了27对同卵双胞胎的全血DNA甲基化图谱。
血液中胰岛素的绝对或相对不足会引发糖尿病,这种疾病在当今社会越来越常见。随着人们生活水平的提高,糖尿病的发病率还在不断攀升。理论上,这样的干细胞能够在随后被操控生成可移植到病人体内的各种细胞。如心脏细胞、肺细胞、肝细胞等。
MeDIP-seq是一种低成本的全基因组DNA甲基化组分析方法。研究人员对测序结果进行了综合性的“组学”分析,鉴定了与T2D有关的甲基化差异区域(DMR)。
研究显示,MALT1基因的启动子存在很显著的差异性甲基化,这个基因涉及了胰岛素和血糖通路,并且与血液中的牛磺胆酸钠水平有关。研究人员将甲基化数据与T2D GWAS meta分析结合起来,发现DMR集中在T2D的易感位点。这项研究的同卵双胞胎,有些是双双罹患T2D,有些只有一人患病。研究人员发现,GPR61和?PRKCB基因的差异性甲基化,只存在于患病情况不同的双胞胎中。进一步研究说明,这两个基因很可能与疾病有因果和先后关系。
这项研究告诉我们,将基因组和表观基因组结合起来对同卵双胞胎进行研究,能够获得重要的疾病线索,为人们提供T2D等复杂疾病的新药物靶标和生物学指标。



