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我国科学家构建完成胚胎发育多组学时空调控图谱数据库

发布时间：2022/12/1 9:31:00编辑：Ma Liang
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记者30日从内蒙古科学技术厅获悉，内蒙古大学左永春教授科研团队在哺乳动物早期胚胎发育的生物信息学研究领域取得重要科研进展，相关成果以《探索哺乳动物胚胎发生时空激活的综合地图集》为题，近日发表于国际学术期刊《核酸研究》。该研究得到国家自然科学基金和自治区关键技术攻关项目的支持。

近年来，哺乳动物发育生物学领域已积累了海量的研究资源和多组学数据，但这些数据资源规模大、维度高、信息碎片化严重，缺乏有效组织整理的资源库。为此，内蒙古大学科研团队利用生物信息学和计算生物学方法创建完成了哺乳动物早期发育的多组学资源库与分析云平台。

科研团队首先完成了基于12种前沿测序技术产生的821个数据集，涉及人、小鼠等物种的9113个样本。随后，将这些数据根据植入前胚胎、胎儿、新生儿的时空发育顺序进行归档整理，共涉及65个不同发育时间点的组织类型和116种细胞类型。此外，23个权威功能知识库的发育相关注释也被人工审编并整合到该数据库。最终，团队构建完成了包含64TB的组学数据和信息注释的资源库，开发了哺乳动物发育多组学在线分析云平台EmAtlas。

随着用户的积极反馈，该平台将会新增更全面的数据资源和分析工具。EmAtlas可以为发育领域的研究人员和临床医师提供有力的分析手段，并为人类遗传疾病、干细胞医疗、辅助生殖和畜牧繁育等提供新的研究思路。同时，该云平台还可以实现从发育的两个尺度（时序、空间），从宏观到微观的五个维度（组织、细胞、基因组、基因、蛋白质）解析哺乳动物早期发育进程。