现代制备色谱柱具有以下特征: （1） 柱长短、内径大、呈圆饼状。常用制备柱的柱长与分析柱相仿,一般为20 ～50cm ,,而内径为10 ～1 000mm ,因此可以在较大的流速下不致产生很高的柱压降,从而获得高的产率。（2） 填料颗粒小,分布窄。采用直径为10 ～20μm 的细颗粒,孔径及粒度分布均很窄的多孔球形或非球形填料替代传统大颗粒（40 ～200μm） 、宽分布的无定形填料填充制备柱,因而具有高得多的柱效,通常每米的塔板数在20 000以上,有的甚至可达到与分析柱相仿的柱效。（3） 流速高。流动相的线速一般在5 ～10cm/min ,以便提高产率,降低生产成本。
制备色谱柱Φ50mm以内，可以使用预装柱，但是Φ50mm以上就必须使用轴向压缩柱。轴向压缩柱可分为静态和动态轴向压缩柱。一般Φ50－Φ100mm可以使用静态或动态轴向压缩柱，但是Φ100m以上制备柱必须使用动态轴向压缩柱。