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外显子组和靶向捕获测序
点击次数:404 发布时间:2017/9/18 16:37:54
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聂**
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靶向测序是指从全基因组中分离并富集特定区域序列进行测序研究。外显子组测序是靶向测序的一种。外显子组区域包 含蛋白质序列编码信息,大部分疾病相关的变异位于外显子组区域。与全基因组重测序相比,外显子组测序更加经济、覆盖 度更深、数据准确性更高,可实现大样本量、高效地发现与疾病或表型相关的遗传变异以及罕见突变,是单基因遗传病和复 杂疾病研究的有力工具!




外显子组和靶向捕获测序的意义
聚焦于基因组中功能最相关的部分! ●所有的外显子,约占基因组的 1% ●绝大部分已知的致病突变发生于外显子区域 ●能够发现孟德尔遗传和复杂疾病的功能性变异位点 ●与全基因组测序相比,减少测序费用,更简便,易于大样本 研究,发现更具统计学意义的序列变异,功能注释更加明确





研究者首先通过全外显子组 捕获测序,获得了 9 例 AML-M5 患者配对样品的全外显子组序列 信息 ,检测到63个基因的蛋白 编码区发生突变。随后,对5例 非配对AML-M5患者样品进行 了全外显子组捕获测序,在 98 例 AML-M5 患者和 509 例正常对照样品中验证了 63 个 基因的突变。通过测序获得的信息,结合文献报道,研 究者锁定 6 个基因(DNMT3A,NSD1,GATA2, CCND3,ATP2A2, C10orf2)进行深入研究。对 6 个基因的所有编码序列百购生物网进行测http://www.gotobio.com/tyyq/gp/zwfg/22578.html序后发现, DNA 甲基转 移酶 3A 的编码基因(DNMT3A)在 AML-M5 患者 中突变率高达 20.5%,其中第 882 位精氨酸密码子的 突变频率达 18.8%。进一步功能研究表明,DNMT3A 的突变位点位于蛋白质的重要功能域,DNMT3A 的突 变与疾病预后相关。该论文首次研究了M5亚型AML 患者的全外显子组序列变异情况,揭示了 DNMT3A 突 变与疾病的关系,为疾病的预后和个体化治疗提供了新 的分子标志物,同时也为其治疗提供了新的分子靶标。
原创作者:北京博奥晶典生物技术有限公司


